When I think about virtual approaches to life science research, all I can say is — This is the way!

生物蛋白的應用：基于Discovery Studio程序包對蛋白質的降解

本文利用Discovery Studio程序包實現基于配體的藥效團的生成和藥效團建模，實現新型FXR受體興奮劑的篩選研究

使用COSMO-RS方法和分子互補性(MC)方法做為組合判據，顯著提高共晶配體的篩選效率。

現代藥物設計過程包括基于計算方法發現、研究和修飾生物活性分子。計算機輔助藥物設計減少了藥物設計周期中的迭代次數，并加快發明和優化過程。此外，它還提供了藥物設計過程中發現更新穎的小分子結構的潛力。由于它基于量子化學，因此COSMOlogic軟件可廣泛應用于整個有機化學領域。用戶可以將其應用于截然不同的新穎化學領域。COSMOsim3D和COSMOsar3D使用本地σ-profiles作為描述符。σ-profiles是從量子化學計算得出，描述分子電子表面的特性，而不是化學結構。因此，它們自然允許支架跳躍和尋找活性類似物。本地σ-profiles提供有關以下信息：●靜電勢●氫鍵能●疏水相互作用●形狀排列和活性相似體搜索使用基于量子化學的分子表面極性，COSMOsim3D是獨特的、穩定的基于場的配體-配體比對的方法。COSMOsim3D相似性是配體相似性的有力描述。因此能夠在生物等排體和隨機對之間進行良好的區分，并允許支架跳躍和尋找活性類似物。ExampleforbioisosterscreeningwithCOSMOsim3D(PDF)3D-QSAR局部σ-profiles陣列是一組新穎的分子相互作用場。他們提供了量化虛擬配體-受體相互作用（包括去溶劑化）所需的所有信息。這導致3D-QSAR研究的預測準確性提高，并且在網格步長、網格定位和隨機未對準方面具有出色的穩定性。ExampleforthepredictivityofaCOSMOsar3Dbased3D-QSARincomparisontoothermethodsontheSutherlanddataset.(PDF)ADME屬性COSMOtherm或COSMOquick中，分子描述符可從表面極性信息和結構參數中得出。用戶可以基于這些有明確物理意義的描述符來構建自己的QSAR模型。許多此類ADME模型可直接使用。

藥物開發是一種開發新的藥物有效成分的高效合成、純化和結晶方法的藝術，該方法的局限性在于僅具有少量且極其昂貴的可用物質，并且面專利時鐘的時間壓力。在這種情況下，計算篩選可能會非常有益。共晶篩選通過API的共晶來優化藥物性能和規避專利已成為藥物開發的重要分支。COSMOquick工具提供了一種快速的工具，根據給定API的共晶可能性對潛在的共晶形成物的龐大列表進行排序，并且還可以對所得的溶解度進行粗略估算。溶解度篩選溶解度通過藥物釋放過程中的溶解作用影響結晶、共晶體或溶劑化物的形成，以及藥代動力學。使用COSMOtherm，可以預測純化合物、共晶體和混合物在幾乎無限范圍的溶劑和溶劑混合物中的溶解度。優化溶劑以進行萃取或下油加工是COSMOtherm的關鍵應用之一。相平衡COSMOtherm提供了廣泛的方法來解決液相、氣相和固相之間的相平衡問題。用戶甚至可以以簡單明了的方式為復雜的任務建模。萃取和純化只是兩個潛在的應用。反應將TURBOMOLE的高級量子化學方法與COSMOtherm的溶劑化自由能預測相結合，研究反應機理?？梢砸园攵康姆绞筋A測平衡常數、甚至動力學常數。使用這種方法可以輕松選擇反應的最佳溶劑。?在我們的反應白皮書中了解更多信息WhitePaperonreactions。